En el siguiente enlace podrás leer un tutorial de como configurar una replica de base de datos en MySQL usando SSL para encriptar la conexión (haciendo imposible que los hackers puedan ver los password o la información transferida entre el maestro y el esclavo).
Mas:
http://comulinux.blogspot.com/2010/02/configurar-replica-en-mysql-usando-ssl.html
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